Provoz kontinuální vs. diskontinuální – při čištění odpadních vod provoz organizujeme buď kontinuálním nebo diskontinuálním způsobem. U kontinuálního provozu dochází k procesu nepřetržitého čištění odpadních vod, tedy neustálému promíchávání, díky kterému mohou bakterie i filtry správně pracovat. Zatímco v diskontinuálním provozu probíhá tzv. sedimentace. ČOV filtruje odpadní vody, poté je vyčištěné odčerpá a přejde do klidového režimu, dokud se opět nenapustí dostatečným množstvím fekálních vod. Tento cyklus je vhodný pro menší provozy, ve kterých není tak velké množství odpadních vod a není nutné udržovat nepřetržitý proces čištění.